直肠黏膜脱垂并无绝对最佳的治疗方式，需依据不同状况予以相应治疗。此病症主要出现在幼儿、已分娩的妇女以及年老体弱人群中，表现为直肠脱出至肛门内、外或黏膜呈现水肿、充血状态，伴有腹泻、出血等症状。其治疗手段需根据不同病情或人群来选定，可分为保守治疗、注射硬化剂治疗以及手术治疗。
一、保守治疗：主要针对患该病的幼儿及轻度直肠黏膜脱垂患者。幼儿随着其成长发育，骶骨弯曲度会逐步形成，通常能够自愈。故而这类患者出现直肠脱垂时可通过用手复位，同时矫正便秘并改进排便习惯，大多能缓解相关症状。
二、注射硬化剂治疗：可在直肠黏膜下层进行注射硬化剂，促使直肠黏膜与肌层粘连，或是在直肠周围注射。该治疗方法对于幼儿和老年人效果还算可以，但应用于一般成人则较容易复发。
三、手术治疗：适用于较为严重的直肠黏膜脱垂。不同手术方式适用于不同病情的患者，比如直肠黏膜结扎术适合存在直肠全层脱垂的患者，肛门紧缩术适用于合并有肛门括约肌松弛的患者，吻合器痔上黏膜环切术适用于Ⅱ度以内的直肠黏膜脱垂。
总之，对于直肠黏膜脱垂的治疗，需要根据具体情况选择合适的方法，以达到较好的治疗效果。