美尔氏综合症的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与内耳膜迷路积水有关，据研究，内淋巴产生和吸收失衡是导致膜迷路积水的重要因素之一。
内淋巴产生过多相关因素
血管纹功能亢进： 血管纹是产生内淋巴的重要结构，当血管纹功能亢进时，会使内淋巴产生过多。比如一些研究发现，在美尔氏综合症患者中，血管纹细胞的离子转运功能可能出现异常，导致钠离子等的转运失衡，进而使得内淋巴生成增多。内分泌紊乱影响： 内分泌因素也可能参与其中。例如，肾上腺皮质功能减退等内分泌疾病可能影响内淋巴的平衡。有研究表明，内分泌紊乱会干扰内环境的稳定，从而增加美尔氏综合症发生内淋巴积水的风险。
内淋巴吸收障碍相关因素
淋巴管道阻塞： 内淋巴通过淋巴管道吸收，若淋巴管道发生阻塞，就会影响内淋巴的吸收。比如炎症等因素可能导致内淋巴管或内淋巴囊出现粘连、狭窄等情况，使得内淋巴的正常吸收通道受阻，进而引起膜迷路积水。像耳部的慢性炎症反复刺激，就可能导致淋巴管道出现阻塞问题。膜迷路自身病变： 膜迷路本身的病变也可能导致吸收障碍。例如膜迷路的上皮细胞功能异常，会影响内淋巴的吸收过程。一些实验研究发现，美尔氏综合症患者的膜迷路上皮细胞存在超微结构的改变，这可能影响其正常的生理功能，包括对内淋巴的吸收功能。
其他可能相关因素
遗传因素影响： 有一定的遗传倾向。研究发现，部分美尔氏综合症患者存在家族聚集现象，提示遗传因素可能在发病中起到作用。某些基因突变可能会使个体更容易患上美尔氏综合症，不过目前具体的相关基因还在进一步的研究探索中。病毒感染因素： 病毒感染也被认为可能是诱因之一。比如腮腺炎病毒、麻疹病毒等感染可能累及内耳，引发内耳的炎症反应，进而影响内淋巴的平衡，增加美尔氏综合症的发病几率。有临床病例观察发现，在美尔氏综合症患者发病前，有过病毒感染史的情况相对较多。