附睾囊肿是否影响生育不能一概而论，一般较小的附睾囊肿通常对生育影响不大，但较大的附睾囊肿可能会有一定影响。据临床统计，约有10% - 15%的附睾囊肿患者可能会出现生育相关问题。
囊肿大小与生育的关系
较小的附睾囊肿：如果附睾囊肿直径小于1厘米，通常对睾丸的生精功能和精子的输送影响较小，一般不太会明显影响生育。这类囊肿往往没有明显症状，可能在体检时偶然发现。较大的附睾囊肿：当附睾囊肿直径大于2厘米时，就可能会压迫附睾管，影响精子的运输。精子需要通过附睾管成熟和储存，囊肿压迫会阻碍精子的正常排出，从而增加男性不育的风险。
囊肿位置对生育的影响
靠近睾丸部位的囊肿：如果附睾囊肿生长在靠近睾丸的部位，可能会直接影响睾丸产生的精子向附睾的输送过程。精子从睾丸生成后，需要经过附睾的一系列处理才能成为成熟的精子，囊肿在这个关键通道上产生压迫，会严重干扰精子的正常转运，进而影响生育。远离睾丸部位的囊肿：相对来说，生长在远离睾丸部位的附睾囊肿对生育的影响相对较小，但也不能完全忽视，随着囊肿增大仍可能会产生一定影响。
囊肿是否合并其他病变
单纯性附睾囊肿：如果只是单纯的附睾囊肿，没有合并其他如附睾炎等病变，那么对生育的影响相对局限。但如果同时合并有附睾炎，炎症会进一步影响附睾的功能，导致精子的质量和运输都受到损害，大大增加了不育的可能性。合并其他病变的囊肿：当附睾囊肿合并有精索静脉曲张等其他生殖系统病变时，生育受到影响的概率会显著提高。多种病变相互作用，会严重干扰生殖系统的正常功能，使得精子的生成、成熟和运输都出现问题，从而影响男性的生育能力。