肠胃功能紊乱时，可使用一些调节胃肠动力、改善消化的药物来缓解症状。比如常用的有马来酸曲美布汀，它能调节胃肠道运动功能，一般可用于改善肠胃功能紊乱引起的腹痛、腹胀等症状。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮：属于外周多巴胺受体拮抗剂，能促进胃肠蠕动，加快胃排空，通常可缓解肠胃功能紊乱导致的腹胀、早饱等症状。成人常用，但需注意，若有胃肠道出血、机械性肠梗阻或穿孔等情况禁用。莫沙必利：是选择性5-羟色胺4（5-HT4）受体激动剂，可促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善消化不良、腹胀等肠胃功能紊乱相关症状。一般适用于成人，但对莫沙必利过敏者禁用。
助消化类药物
乳酶生：是一种传统的助消化药物，为活肠球菌的干燥制剂，能在肠内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制肠内病原菌繁殖，并防止蛋白质发酵，适用于消化不良、肠胃功能紊乱引起的腹胀等。一般无明显禁忌，但抗生素会抑制其活性，故不宜同服。复方消化酶：含有多种消化酶，如胰蛋白酶、胰淀粉酶、胰脂肪酶等，能促进食物消化，改善因肠胃功能紊乱导致的食欲不佳、餐后饱胀等症状。不同年龄段有不同注意事项，儿童需在成人监护下使用，对本品过敏者禁用。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片：含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等肠道有益菌，能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善肠胃功能紊乱引起的腹泻、便秘等症状。儿童可服用，但服用时需用温水送服，避免与抗菌药物同服。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：主要成分是地衣芽孢杆菌，可抑制有害菌生长，调整肠道菌群，适用于肠胃功能紊乱引起的肠炎、腹泻等。儿童用药需咨询医生，对本品过敏者禁用。