肠胃功能紊乱可以使用一些调节胃肠动力、改善消化的药物。比如常用的有多潘立酮，它能促进胃肠蠕动，一般可以缓解腹胀等症状；还有复方消化酶制剂，能帮助消化。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮： 属于外周多巴胺受体阻滞剂，能直接作用于胃肠壁，增加胃肠道的蠕动和张力，促进胃排空，一般可缓解因胃肠功能紊乱引起的腹胀、恶心等症状。莫沙必利： 是选择性5-羟色胺4（5-HT4）受体激动剂，能促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道蠕动，改善功能性消化不良、胃肠功能紊乱引起的相关症状。
改善消化类药物
复方消化酶： 含有多种消化酶，如胃蛋白酶、胰蛋白酶等，能促进食物的消化，帮助胃肠功能紊乱患者更好地消化摄入的食物，缓解消化不良等问题。乳酸菌素片： 可以在肠道内形成保护层，阻止病原菌、病毒的侵袭，还能刺激肠道分泌抗体，提高肠道免疫力，促进有益菌的生长，调节肠道菌群，改善胃肠功能紊乱。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等四种有益菌，能补充肠道有益菌群，调整肠道菌群失调，改善胃肠功能紊乱引起的腹泻、便秘等情况。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 以活菌进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌等有益菌则有促进生长作用，从而调整肠道菌群失调，改善胃肠功能。
对症治疗的其他药物
匹维溴铵： 是一种对胃肠道具有高度选择性解痉作用的钙拮抗药，主要用于与肠道功能紊乱有关的疼痛、排便异常和胃肠不适，以及与胆道功能紊乱有关的疼痛。曲美布汀： 可调节胃肠道运动功能，对胃肠道平滑肌有双向调节作用，能改善胃肠功能紊乱引起的食欲不振、恶心、呕吐、腹胀、腹痛、腹泻、便秘等症状。