尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50% - 70%的尿道炎是由单一细菌感染导致的。
病原体感染原因
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它是肠道常驻菌，当机体抵抗力下降或尿道黏膜有损伤时，就容易侵入尿道引发感染。比如女性尿道短而宽，且靠近肛门，更容易被大肠杆菌等细菌感染。支原体、衣原体感染： 支原体和衣原体也可引起尿道炎，它们主要通过性接触传播。在性活跃的人群中，感染支原体、衣原体导致尿道炎的情况较为常见。例如，有多个性伴侣的人感染风险会明显增加。
尿道局部因素
尿道梗阻： 如尿道结石、狭窄等情况会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内停留时间过长，有利于细菌滋生繁殖，从而引发尿道炎。比如尿道结石患者，结石阻碍了尿液的正常排出，就容易继发尿道感染。尿道损伤： 尿道器械检查、性生活等都可能造成尿道黏膜损伤，使细菌容易侵入引发炎症。像进行导尿操作时，如果消毒不严格，就可能导致尿道损伤并引发感染。
机体免疫力低下
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖较高，有利于细菌生长繁殖，而且机体抵抗力相对较低，容易发生尿道炎。据统计，糖尿病患者发生泌尿系统感染包括尿道炎的概率比正常人高很多。长期使用免疫抑制剂者： 一些患有自身免疫性疾病需要长期使用免疫抑制剂的患者，机体的免疫功能受到抑制，抵御病原体的能力下降，容易受到病原体侵袭引发尿道炎。