胆固醇低可能由多种原因引起。一般来说，一些疾病因素可能导致胆固醇低，比如甲状腺功能亢进症，这类患者体内甲状腺激素水平升高，会加快体内物质代谢，包括影响胆固醇的代谢，使得胆固醇合成减少，从而出现胆固醇低的情况；还有肝脏疾病，像重症肝炎、肝硬化等，肝脏是合成胆固醇的重要场所，肝脏功能受损时，胆固醇合成能力下降，也会导致胆固醇水平降低。
疾病相关因素
甲状腺功能亢进症： 甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，会加速机体新陈代谢，包括对胆固醇的代谢过程，使得胆固醇分解代谢加快，进而造成血液中胆固醇含量降低。患者除了胆固醇低，往往还会有怕热、多汗、心慌、手抖、体重下降等症状。肝脏疾病影响： 重症肝炎患者，肝脏细胞受损严重，影响了胆固醇的合成途径，导致胆固醇生成减少；肝硬化患者肝脏结构和功能发生改变，也会使胆固醇合成能力下降。这类患者除胆固醇低外，可能伴有乏力、食欲减退、黄疸等表现。
饮食方面因素
过度节食或偏食： 如果长期过度节食，摄入的营养物质不足，其中包括合成胆固醇所需的原料缺乏，就可能引起胆固醇低。比如只吃很少量的肉类、蛋类等富含胆固醇的食物，同时蔬菜、水果等其他食物也摄入不均衡，长期如此就会影响胆固醇的合成。营养不良状态： 长期营养不良的人，身体处于缺乏各种营养物质的状态，胆固醇的合成原料不足，会导致体内胆固醇水平降低。这类人群往往身体瘦弱，免疫力也比较低，容易生病。
其他因素
年龄与性别差异： 老年人胆固醇水平相对可能偏低一些，这与老年人身体代谢功能减退有关。另外，部分女性在某些特殊时期，如绝经后，由于体内激素水平变化，也可能出现胆固醇低的情况。比如绝经后的女性，体内雌激素水平下降，会影响胆固醇的代谢平衡，导致胆固醇含量降低。药物影响： 某些药物也可能引起胆固醇低，例如一些降脂药物如果使用不当，可能会过度降低胆固醇水平；还有一些抗癫痫药物等，也可能对胆固醇代谢产生影响，导致胆固醇降低。但药物导致胆固醇低的情况相对较少见，一般是在特定用药情况下才会出现。