肛门外长有小肉疙瘩的原因可能有以下几种：
1.外痔：是齿状线以下的痔外静脉丛扩大曲张所形成的柔软静脉团，常见于肛门缘周围或肛门内，可伴有疼痛、瘙痒、便血等症状。
2.内痔：生于齿线以上，由粘膜下痔内静脉丛扩大曲张所形成柔软的静脉团，内痔早期无明显症状，随着痔核逐渐增大，可出现便血、痔核脱出、肛门瘙痒等症状。
3.混合痔：内痔和外痔同时存在，可出现便血、肛门疼痛、肛门瘙痒、痔核脱出等症状。
4.肛周脓肿：是指肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，可出现肛门周围疼痛、肿胀、发热等症状。
5.直肠息肉：是直肠黏膜表面突出的赘生物，可无明显症状，也可出现便血、脱垂、肠道刺激症状等。
6.肛管鳞状细胞癌：肛管部位的鳞状上皮细胞发生癌变，可出现肛门瘙痒、疼痛、出血、肛门周围肿块等症状。
7.其他：肛门尖锐湿疣、直肠脱垂、肛乳头肥大等也可导致肛门外长有小肉疙瘩。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合患者的症状、体征、实验室检查等综合判断。如果出现肛门外长有小肉疙瘩的情况，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。