男性生殖器疼痛的原因包括尿道病变、海绵体病变以及外伤等。
一、尿道病变：部分男性患者存在尿道炎、尿道结石、尿道肿瘤等尿道病变情况。此时可能引发尿道持续性疼痛，这种疼痛可放射至会阴处，或导致海绵体疼痛，同时往往伴有尿频、尿急、血尿等症状表现。一旦出现这些症状，就需要前往医院进一步做尿常规、泌尿系统B超等检查项目，以明确具体病因。
二、海绵体病变：有些男性若有海绵体感染、海绵体硬化等病症，均会产生疼痛，还可能出现勃起功能障碍或勃起时疼痛。需要到正规医院进行血常规化验，以及开展海绵体超声检查来明确病因。
三、外伤：当遭受到外界打击时会出现疼痛，通常会有明确的受伤经过。若造成了白膜损伤即断裂，甚至需要进行急诊手术予以治疗。
所以，当男性出现生殖器疼痛时，建议到医院泌尿外科进行检查，通过专业医生的检查来明确病因，并遵循医嘱进行治疗。
总结：本文主要阐述了男性生殖器疼痛的三种原因，包括尿道病变及其伴随症状与检查方法，海绵体病变的具体情况和诊断方式，以及外伤导致疼痛的特点和严重时的处理办法，强调了出现疼痛时应及时就医检查和治疗。