直肠脱垂的治疗方法需根据病情严重程度来定，一般来说，轻度直肠脱垂可通过非手术治疗改善，中重度可能需要手术。比如，对于儿童的轻度直肠脱垂，多数可通过保守治疗好转。
非手术治疗为主
一般治疗： 对于幼儿直肠脱垂，多数可在5岁前自愈，主要是注意缩短排便时间，排便后立即将脱出直肠复位，取俯卧位，用纱布卷堵住肛门，再用丁字带固定。成人轻度脱垂也可通过坚持做提肛运动，增强肛门括约肌功能，缓解脱垂。药物治疗： 可使用硬化剂注射治疗。常用的硬化剂有5%苯酚植物油、5%盐酸奎宁尿素水溶液等。将硬化剂注射到脱垂部位的黏膜下层内，使黏膜与肌层产生无菌性炎症，粘连固定。不过，注射时要注意避免误入血管，引发严重并发症。
手术治疗情况
经腹手术： 适用于成人完全性直肠脱垂。常用的有Ripstein手术，是经腹直肠悬吊固定术，将直肠固定在骶骨前筋膜上。还有Delorme手术，适用于直肠黏膜脱垂，是将脱垂的黏膜层切除并折叠缝合。经会阴手术： 适用于年老体弱或伴有严重心、肺疾病不能耐受经腹手术者。如肛门环缩术，是用金属线或硅胶管等埋于皮下，使肛门缩小，阻止直肠脱垂。但该手术有一定复发率。
不同人群的治疗注意事项
儿童直肠脱垂： 儿童直肠脱垂多为黏膜脱垂，以非手术治疗为主。因为儿童身体处于发育阶段，手术可能会对其生长发育产生影响。在治疗过程中，要注意调整儿童的饮食，多吃富含纤维素的食物，保持大便通畅，避免便秘和腹泻。成人直肠脱垂： 成人直肠脱垂如病情较重，非手术治疗效果不佳时才考虑手术。但手术有一定风险，尤其是老年患者伴有其他基础疾病时，手术前要全面评估身体状况。术后要注意休息，避免剧烈活动，防止复发。