胃食管反流通常是由多种因素共同作用引起的。比如，下食管括约肌功能障碍是常见原因之一，正常情况下下食管括约肌能阻止胃内容物反流至食管，当它压力降低时，就容易引发反流，有研究显示约有40% - 60%的胃食管反流患者存在下食管括约肌压力降低的情况。
食管清除作用异常
食管蠕动异常： 食管蠕动可以帮助将反流的胃内容物及时清除，若食管蠕动出现异常，就会影响清除效率。例如，老年人食管蠕动功能可能会减退，相对更容易发生胃食管反流。唾液分泌减少： 唾液能起到中和胃酸、清除食管内反流物的作用，当唾液分泌减少时，食管的清除能力也会下降。比如一些患有干燥综合征的患者，唾液分泌不足，胃食管反流的发生风险可能会增加。
胃排空延迟
饮食习惯影响： 进食过多、过快，或者吃了过多高脂肪、巧克力、咖啡等食物，都可能导致胃排空延迟。比如一次性进食大量油腻食物后，胃的排空时间会延长，胃内压力升高，更容易使胃内容物反流至食管。疾病因素： 某些疾病也会引起胃排空延迟，像糖尿病患者由于自主神经病变，可能会出现胃轻瘫，导致胃排空减慢，进而引发胃食管反流。约有50%的糖尿病患者会合并胃食管反流问题。