慢性肠胃炎常见症状多样，其中腹痛较为常见，多数患者会有腹部隐痛的情况，疼痛程度不一，有的可能是轻度胀痛，有的则是间断性的钝痛。
消化系统症状表现
腹胀： 患者常常会感觉腹部胀满，尤其是在进食后较为明显，有的患者腹胀可持续数小时甚至一整天。比如一些慢性肠胃炎患者，进食一碗米饭后，就会明显觉得肚子发胀，长时间不缓解。腹泻： 多数患者会出现腹泻症状，大便次数增多，一般每天3 - 5次不等，大便质地较稀，可为糊状便，严重时可能出现水样便。部分患者腹泻与进食有关，进食油腻、刺激性食物后腹泻症状容易加重。恶心呕吐： 有些慢性肠胃炎患者会有恶心的感觉，严重时可能出现呕吐，呕吐物多为胃内容物，一般为少量，一天可能出现1 - 2次呕吐情况。
全身症状体现
乏力： 由于胃肠道长期不适，影响营养吸收，患者容易出现乏力感，精神状态不佳，日常活动后更容易感到疲惫，比如原本可以快走半小时的人，患病后可能快走10分钟就觉得很累。消瘦： 如果病情较长时间没有得到有效控制，患者可能会出现体重下降、消瘦的情况，一般在数月内体重可减轻2 - 5公斤左右，如果不及时干预，消瘦情况可能会进一步加重。
其他相关症状
食欲不振： 患者对食物的兴趣降低，吃饭时没有明显的饥饿感，食量较患病前减少，可能一顿饭只能吃原来的一半量甚至更少。反酸烧心： 部分慢性肠胃炎患者会出现胃酸反流的情况，感觉胸骨后有灼热感，也就是常说的烧心，同时伴有反酸，胃酸向上反流至口腔，偶尔会有酸味。