遗尿症的成因较为复杂，可能与多种因素相关。一般来说，3岁以上仍频繁出现不自主排尿的情况就可能涉及遗尿症问题。
神经系统发育迟缓
神经调控不完善： 儿童在3岁左右神经系统才逐渐发育完善，若此时神经调控膀胱排尿的功能还没完全成熟，就可能出现遗尿。比如约15%的5岁遗尿儿童存在膀胱充盈时脑电波唤醒功能障碍。脊髓神经问题： 脊髓的神经传导如果出现异常，也可能影响排尿反射的正常进行。例如脊髓栓系综合征可能导致神经传导受阻，引发遗尿。
膀胱功能异常
膀胱容量小： 有些孩子膀胱容量比正常同龄人小，比如正常5岁孩子膀胱容量约300毫升，而遗尿症孩子可能不足150毫升，就容易频繁产生尿意导致遗尿。逼尿肌不稳定： 膀胱逼尿肌会不自主收缩，使得膀胱提前产生尿意，还没到正常排尿时间就忍不住排尿，从而引发遗尿。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 遗尿症具有一定遗传相关性，如果父母一方有遗尿症病史，孩子患遗尿症的概率比正常家庭孩子高约4倍。研究发现，约70%的遗尿症患儿直系亲属中有遗尿病史。
心理因素作用
精神紧张焦虑： 孩子受到突然的惊吓、生活环境改变等情况，导致精神紧张焦虑，也可能诱发遗尿。比如换新学校、父母离异等事件后，部分孩子会出现遗尿现象。心理压力过大： 长期处于较大心理压力下，如学业负担重等，会干扰神经系统对排尿的控制，进而引发遗尿。