脑出血后遗症的病因主要与脑出血本身的情况以及后续的相关因素有关。一般来说，脑出血后导致神经功能缺损等后遗症，其常见病因包括以下方面。
脑出血本身的因素
出血部位影响：如果脑出血发生在重要的功能区域，比如内囊部位，这里是神经纤维集中走行的地方，出血后容易破坏神经纤维的正常传导，从而更容易遗留严重的后遗症。据统计，约有40% - 50%的脑出血患者因为出血部位在关键功能区而出现较明显的后遗症。出血量大小：出血量较大时，对脑组织的破坏范围广，周围脑组织受压严重，脑水肿等情况更明显，后续恢复相对困难，遗留后遗症的概率也更高。一般出血量超过30毫升的脑出血患者，出现后遗症的可能性比小出血量的患者要高2 - 3倍。
基础疾病相关因素
高血压：高血压是导致脑出血最常见的基础疾病。长期高血压会使脑血管壁变得脆弱，形成微动脉瘤，当血压突然升高时，微动脉瘤容易破裂出血。据调查，80%以上的脑出血患者有高血压病史。而且高血压控制不佳的患者，再次发生脑出血以及遗留严重后遗症的风险会大大增加。动脉硬化：动脉硬化会使血管弹性下降，血管壁增厚、变硬，血液流动受阻，也容易引发脑出血。同时，动脉硬化会影响脑组织的血液供应，导致脑组织缺血缺氧，进而加重脑出血后的神经功能损伤，增加后遗症发生的几率。
康复相关因素
康复治疗不及时或不规范：脑出血患者在病情稳定后需要及时进行康复治疗，包括肢体功能康复、语言康复等。如果康复治疗开始时间延迟，比如在脑出血后2周甚至更晚才开始康复，那么神经功能恢复的效果会大打折扣。而且康复治疗如果不规范，没有按照科学的康复方案进行，比如肢体康复训练的强度、频率不合适等，也会影响后遗症的恢复情况。例如，有研究发现，规范康复治疗的患者比不规范康复治疗的患者，肢体运动功能恢复良好的概率要高30%左右。并发症影响：脑出血患者容易出现多种并发症，如肺部感染、尿路感染、深静脉血栓等。肺部感染会影响患者的呼吸功能，导致机体缺氧，进一步加重脑组织的损伤；尿路感染会引起发热等全身症状，也会对患者的康复产生不利影响；深静脉血栓如果脱落，还可能导致肺栓塞等严重并发症，这些并发症都会干扰患者的康复进程，从而增加脑出血后遗症的严重程度。