跑步膝盖两侧疼可能由运动时间过长、软组织损伤、膝关节炎、髌骨软化症、半月板损伤等引发。
一、运动时间过长：长时间跑步可能刺激并损伤膝关节两侧组织，导致酸胀、疼痛等症状出现。对此，建议合理安排跑步时间，适度减少运动量，同时可在医生指导下通过按摩、热敷等方式缓解不适。
二、软组织损伤：跑步姿势不当易使膝关节两侧软组织受损，从而引起疼痛、肿胀等表现。可遵医嘱服用塞来昔布胶囊、布洛芬胶囊等药物进行治疗。
三、膝关节炎：这是以膝关节软骨退变和骨赘为特征的疾病，跑步可诱发其发作，带来膝关节疼痛、活动障碍等症状。患者可在医生指导下服用美洛昔康片、吡罗昔康片等抗炎止痛药物。
四、髌骨软化症：通常因髌骨软骨面存在慢性损伤导致，会有膝前痛、髌骨下疼痛、膝关节疼痛等症状，跑步后症状更为显著。可遵医嘱服用双氯芬酸钠缓释片、阿仑膦酸钠片等药物进行治疗。
五、半月板损伤：会影响膝关节功能，引发肿胀、疼痛、活动受限等情况。患者需按医生指导进行治疗。
建议患者前往正规医院就诊，明确诊断后确定进一步治疗方式。