肛周脓肿主要是肛腺感染引起的，约90%的肛周脓肿由肛腺阻塞感染所致。比如肛腺开口于肛窦，若肛窦受损伤，粪便等异物进入肛窦就易引发肛腺感染，感染蔓延可形成肛周脓肿。
肛腺感染相关因素
肛窦损伤： 腹泻、便秘等情况易导致肛窦损伤，比如长期腹泻的人，粪便频繁刺激肛窦，使肛窦黏膜受损，细菌就容易入侵肛腺引发感染。肛腺阻塞： 肛腺分泌的黏液能润滑肠道，但如果肛腺导管被堵塞，黏液无法正常排出，就为细菌滋生创造了条件，进而引发感染形成肛周脓肿。
全身抵抗力下降因素
营养不良人群： 长期营养不良会使身体抵抗力降低，像一些贫困地区长期以单一食物为主的人群，营养不均衡，身体对抗细菌感染的能力减弱，更容易患上肛周脓肿。患有基础疾病人群： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，高血糖环境利于细菌生长繁殖，身体抵抗力也会下降，比普通人更易发生肛周脓肿。比如血糖长期高于11.1mmol/L的糖尿病患者，肛周感染的风险明显增加。
局部因素影响
肛门局部卫生不良： 不注意肛门局部清洁，粪便残留容易污染肛门周围，细菌大量繁殖，增加肛周感染的几率。比如有些老年人行动不便，不能很好地清洁肛门，就容易引发肛周脓肿。肛门外伤： 肛门部位受到外伤，如异物损伤、暴力撞击等，会破坏肛门周围的防御屏障，细菌容易侵入引发感染形成肛周脓肿。例如肛门部位被尖锐物体划伤后，如果没有及时处理，就可能发展为肛周脓肿。