胎儿停止发育的原因较多，据统计，约50% - 60%的早期胚胎停止发育是由于染色体异常导致的。
染色体因素：
父母染色体异常： 如果父母双方任何一方存在染色体数目或结构的异常，就有可能遗传给胎儿，从而引起胎儿停止发育。例如，常见的平衡易位、罗伯逊易位等染色体结构异常，会增加胎儿染色体异常的风险，进而导致胎儿停止发育。胎儿自身染色体异常： 胎儿在发育过程中，自身染色体发生突变等情况，也会引发停止发育。这种情况是胎儿自身遗传物质出现了问题，导致其无法正常发育生长。
母体因素：
内分泌失调： 比如黄体功能不全，在怀孕早期，黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，就不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，容易造成胎儿停止发育。一般来说，黄体期短于12天，就可能存在黄体功能不全的情况。还有甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能亢进还是减退，都会影响胎儿的生长发育，甲状腺激素水平异常会干扰胚胎的正常发育进程，增加胎儿停止发育的几率。子宫异常： 子宫畸形是常见的原因之一，像单角子宫、双角子宫等子宫结构异常，会影响子宫的容积和内环境，使得胚胎难以正常着床和发育。另外，子宫肌瘤也可能对胎儿造成影响，如果肌瘤位于宫腔内，会影响胚胎的着床位置和生长空间，导致胎儿停止发育；即使肌瘤在宫腔外，如果体积较大，也可能影响子宫的血供，间接影响胎儿发育。
免疫因素：
自身免疫性疾病： 例如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胎盘等组织，破坏胎盘的正常功能，影响胎儿的血液供应和营养物质的输送，从而导致胎儿停止发育。同种免疫异常： 母体对胎儿的免疫耐受异常，母体免疫系统将胎儿视为“异物”进行攻击，引发免疫排斥反应，干扰胚胎的正常发育，最终导致胎儿停止发育。
环境因素：
化学物质接触： 孕妇长时间接触一些有毒有害的化学物质，像苯、甲醛等。这些化学物质可能通过胎盘影响胎儿的发育，破坏胎儿的细胞结构和遗传物质，增加胎儿停止发育的风险。例如，在一些化工环境中工作的孕妇，接触这些化学物质的机会较多，胎儿停止发育的可能性相对更高。辐射暴露： 过量的辐射照射，如孕妇接受了大剂量的X线检查等，辐射会损伤胎儿的细胞，影响胎儿的生长发育，导致胎儿停止发育。一般来说，孕妇接受超过一定剂量的辐射，就可能对胎儿造成不良影响。