鱼鳞病主要是遗传因素导致的，约70%的患者有遗传背景。其中常见的是寻常型鱼鳞病，是由12号染色体上的丝聚合蛋白原基因缺陷引起；性联隐性鱼鳞病则是X染色体上类固醇硫酸酯酶基因缺失或突变所致。
遗传因素主导
常染色体显性遗传寻常型鱼鳞病：这是最常见的类型，约占鱼鳞病患者的80%。父母一方如果患有该病，子女有50%的概率遗传患病。比如父母一方患病，其子女从基因遗传角度有一半机会携带致病基因从而发病。性联隐性遗传鱼鳞病：主要发生在男性身上，女性多为携带者。男性患者的致病基因来自母亲，母亲携带的致病基因位于X染色体上，男性继承了异常的X染色体就会发病。
角质形成细胞分化和表皮屏障功能异常
角质形成细胞分化异常：正常情况下，角质形成细胞会有序分化成熟并脱落。但在鱼鳞病患者中，角质形成细胞分化过程出现问题，导致角质层的形成异常。例如寻常型鱼鳞病患者，丝聚合蛋白原水解缺陷，使得角质层水分保持能力下降，皮肤变得干燥。表皮屏障功能受损：皮肤的屏障功能主要由角质层等结构维持，鱼鳞病患者的表皮屏障功能出现障碍，经表皮水分丢失增加。比如经表皮水分丢失量比正常人高出数倍，这就会使皮肤更加干燥，容易出现鳞屑等症状。
其他相关因素影响
环境因素辅助加重：干燥的气候会加重鱼鳞病的症状。在秋冬季节，空气湿度低，鱼鳞病患者皮肤的水分更容易流失，鳞屑会增多、增厚，皮肤瘙痒等不适也会更明显。而且皮肤长期接触刺激性物质，像碱性较强的肥皂等，也会刺激皮肤，让鱼鳞病病情恶化。内分泌变化的作用：甲状腺功能低下可能与鱼鳞病的发生发展有关。有研究发现，部分鱼鳞病患者存在甲状腺功能指标异常，甲状腺素分泌不足可能影响皮肤的正常代谢，导致皮肤角质代谢紊乱，加重鱼鳞病的表现。