面肌痉挛主要是由于面神经受到血管压迫引起的，约80% - 90%的面肌痉挛是因为面神经根部被一根或多根动脉或静脉压迫所致。
血管压迫因素
动脉压迫： 脑内的动脉，比如小脑上动脉、小脑前下动脉等，这些动脉在走行过程中可能靠近面神经根部，随着年龄增长，动脉会发生一定程度的硬化、迂曲，就容易对面神经造成持续的压迫。血管搏动性的刺激会影响面神经的正常传导，从而引发面肌痉挛。静脉压迫： 静脉也可能压迫面神经，虽然静脉压力相对动脉较低，但长期的压迫同样会干扰面神经的正常功能，导致面肌痉挛的发生。
面神经发育异常
先天性因素： 部分人可能存在面神经本身的发育异常，比如面神经髓鞘发育不完善等情况。这种先天性的结构异常使得面神经的电生理活动容易出现紊乱，进而引发面肌痉挛。一般在出生后就存在潜在的发病基础，但可能在某些诱因下才会发病，比如劳累、精神紧张等因素可能会促使面肌痉挛症状显现出来。
其他罕见因素
肿瘤影响： 颅内的一些肿瘤，像听神经瘤、脑膜瘤等，虽然比较罕见，但它们可能会对面神经产生压迫或侵犯，从而导致面肌痉挛。不过这类情况相对较少见，通常除了面肌痉挛外，还会伴有其他相应肿瘤的症状，比如听神经瘤可能会有听力下降等表现。炎症刺激： 面神经周围的炎症，比如中耳炎、乳突炎等疾病，炎症的刺激可能会波及面神经，引起面神经的兴奋性改变，进而引发面肌痉挛。但这种情况相对来说发病率也不高，而且在控制炎症后，面肌痉挛的症状可能会有所缓解。