脑梗塞治疗中常用的药物有溶栓药物、神经保护剂等，但不存在绝对“最好”的药，需根据病情阶段等选择。一般在发病4.5小时内符合溶栓指征的患者，可使用阿替普酶等溶栓药物，能使部分堵塞血管再通。
溶栓类药物
重组组织型纤溶酶原激活剂（阿替普酶）：适用于发病4.5小时内的脑梗塞患者，能通过激活纤溶酶原转化为纤溶酶，溶解血栓，使堵塞血管再通，改善脑部血液供应，但使用有严格时间窗和禁忌证限制，比如近期有脑出血、严重高血压等情况不能用。
神经保护剂
依达拉奉：是一种自由基清除剂，可抑制脂质过氧化，减轻脑梗塞引起的神经细胞损伤。临床研究表明，它能改善脑梗塞患者的神经功能缺损症状，通常通过静脉滴注给药，一般每天使用一定剂量，连续使用一段时间。胞磷胆碱钠：可以改善脑代谢，促进大脑功能恢复，能增强脑干网状结构上行激活系统的功能，促进苏醒，还能增加脑血流量，改善脑循环，常用于脑梗塞后的辅助治疗，一般口服或静脉用药，具体用量需遵医嘱。
抗血小板聚集药物
阿司匹林：通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集，预防血栓形成。一般建议脑梗塞患者长期小剂量服用，比如每天75~100毫克，但有胃肠道出血等病史的患者需谨慎使用，要定期监测血常规等指标。氯吡格雷：也是抗血小板聚集药物，作用机制与阿司匹林有所不同，它能选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于一些不能耐受阿司匹林或阿司匹林治疗效果不佳的患者，可考虑使用氯吡格雷，用法一般是每天一次，每次一定剂量，同样要注意出血等不良反应。