喉咙里咳出的小颗粒发臭，可能与以下原因有关。
1.扁桃体结石：扁桃体表面有许多凹陷，称为扁桃体隐窝。当扁桃体发生慢性炎症时，脱落的上皮细胞、白细胞、细菌等物质会在隐窝中积聚，形成白色的颗粒样物质，即为扁桃体结石。这些结石会散发出恶臭。
2.食物残渣残留：如果进食后有食物残渣残留于扁桃体隐窝，经过细菌发酵后也会产生异味。
3.其他：如鼻窦炎、胃食管反流病等也可能导致喉咙里咳出的小颗粒发臭。
如果喉咙里咳出的小颗粒发臭，建议及时就医，明确原因，并进行相应的治疗。同时，要注意保持口腔清洁，勤漱口，避免食用辛辣、刺激性食物。