子宫内膜异位的常见原因包括：一、种植学说经血逆流会导致内膜种植。在月经期，经血通常是从宫口、阴道顺流而下排出体外，但有一小部分经血可能会夹杂着脱落的子宫内膜碎片，通过输卵管道流入腹腔，而后种植在盆腔脏器的表层，进而形成子宫内膜异位病灶。
二、化生内膜浆膜上皮可以化生内膜。在人体胚胎发育时期，卵巢表面上皮、腹膜、阴道直肠膈、脐部等均是由体腔上皮化生而来，这些组织在性腺激素、炎症、机械因素等的刺激下能够发生转化，形成另一种组织，并且同样有可能化生为子宫内膜。
三、良性转移通过血液、淋巴可进行良性转移。出现在肺部、脑膜、心包、四肢以及其他远端的子宫内膜异位症，是子宫内膜碎屑借助血液循环或淋巴系统转移并停留在某脏器或组织上而引发的疾病。
四、医源性的内膜移植这是人为造成的子宫内膜移植到某些部位的情况，常见于剖宫产术、早期中期妊娠行刮宫术、分娩时行会阴侧切术、人工流产术等过程中。
五、免疫防御功能缺陷随经血逆流至腹腔的子宫内膜如同一种异物，会激活体内的免疫系统，促使大量的免疫细胞及体液进行围歼消除，如果体内免疫功能存在缺陷，就可能发展成为子宫内膜异位症。
六、遗传因素子宫内膜异位症具有一定的遗传倾向和家族聚集性，有家族病史的人更容易患此病。
总之，子宫内膜异位的产生原因较为多样且复杂。