子宫内膜异位症的发生主要与多种因素有关。目前认为，子宫内膜异位的原因主要有以下这些方面。首先，经血逆流是一个重要因素，有研究发现，在女性月经期间，大约有10%左右的女性会出现经血逆流的情况，脱落的子宫内膜细胞会随着经血通过输卵管逆流进入盆腔，种植在盆腔其他部位，从而引发子宫内膜异位症。
经血逆流相关
经血逆流机制： 在正常情况下，月经血是从子宫经宫颈、阴道流出体外，但部分女性在月经期间，由于盆腔解剖结构等因素，月经血会通过输卵管逆流进入盆腔。高发人群： 有先天性生殖道畸形的女性，比如阴道横隔、处女膜闭锁等，经血逆流的概率相对更高。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 如果家族中有女性患有子宫内膜异位症，那么其他女性患该病的风险会比正常人群高。据统计，有家族史的女性患子宫内膜异位症的几率比无家族史女性高7 - 10倍。遗传方式： 目前研究发现，子宫内膜异位症可能与某些基因的突变或遗传易感性有关，但具体的遗传机制还在进一步探索中。
免疫防御功能异常
免疫监视作用减弱： 正常情况下，人体的免疫系统能够监视并清除异位的子宫内膜细胞。但当免疫防御功能出现异常时，比如巨噬细胞、自然杀伤细胞等免疫细胞的功能发生改变，就不能有效地清除逆流到盆腔的子宫内膜细胞，使得这些细胞在盆腔内种植、生长，进而引发子宫内膜异位症。自身免疫反应： 部分女性可能存在自身免疫反应异常，身体的免疫系统错误地将异位的子宫内膜细胞当作外来异物进行攻击，但这种攻击没有起到清除作用，反而导致子宫内膜细胞在局部持续存在并生长。