病毒疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的。HPV有多种亚型，不同亚型会导致不同类型的病毒疣。
感染途径分类
直接接触感染：
皮肤接触： 与患有病毒疣的人直接皮肤接触，就有可能被感染。比如，经常在公共浴室、泳池等场所，皮肤直接接触到被病毒污染的物品表面，就有感染风险。据统计，在皮肤直接接触传播的情况下，感染几率会随着接触时间和接触频率的增加而上升。黏膜接触： 当与感染者的黏膜部位接触时也可能被感染，像性接触就属于黏膜接触的一种情况，通过性接触感染的病毒疣多见于生殖器部位的尖锐湿疣等。
间接接触感染：
共用物品感染： 使用被病毒污染的物品，如毛巾、浴巾、内裤等，也可能引发病毒疣。如果一个健康人使用了患有病毒疣者用过的毛巾，而毛巾上残留有病毒，就有可能被传染。不过这种间接接触感染的几率相对直接接触要低一些，但也不能忽视。母婴传播： 母亲如果患有生殖道的病毒疣，在分娩过程中，胎儿通过产道时可能会感染病毒，从而引发婴幼儿的病毒疣，比如婴幼儿的喉乳头瘤病可能就是通过母婴传播感染的。
自身因素分类
免疫力低下：
健康人群： 当人体的免疫力处于较低水平时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，身体对HPV的抵御能力下降，就更容易感染病毒疣。例如，长期熬夜的人比作息规律的人感染病毒疣的可能性要高约30%。特定人群： 像艾滋病患者，由于其免疫系统受到严重破坏，免疫力极低，感染HPV后发生病毒疣的几率远远高于正常人，而且病情往往更严重，难以控制。
皮肤黏膜破损：
皮肤有破损： 当皮肤出现破损，如擦伤、割伤等情况时，HPV更容易侵入人体引发感染。比如，手上有小伤口时接触到带有病毒的物品，就容易感染导致手部出现病毒疣。黏膜有破损： 口腔、生殖器等部位的黏膜如果有破损，同样为HPV的入侵打开了方便之门，增加了感染病毒疣的风险，比如有口腔溃疡的人接触到病毒后更易感染口腔部位的病毒疣。