口腔溃疡的引发原因较多，比如有超过20%的人群可能因遗传因素而患上口腔溃疡，若家族中有口腔溃疡患者，其患病几率相对更高。
一、局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔内壁，就容易引发口腔溃疡，这种情况在吃饭速度快、注意力不集中的人群中较为常见。尖锐牙尖刺激： 口腔内如果有较为尖锐的牙尖，长期摩擦口腔黏膜，也会导致口腔溃疡的发生，据统计，约有15%的口腔溃疡患者是因为牙齿的尖锐牙尖刺激引起的。
二、免疫系统因素
免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如感冒发烧、过度劳累后，身体的免疫防御功能下降，就容易受到病原体侵袭，从而引发口腔溃疡，一般免疫力低下的人每年可能会有1 - 2次口腔溃疡发作。自身免疫反应异常： 当自身免疫系统出现异常时，会错误地攻击口腔黏膜，导致口腔溃疡，这种情况在一些自身免疫性疾病患者中较为常见，如白塞病患者就常常伴有口腔溃疡症状。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是维生素B族缺乏，像维生素B2、B6等缺乏时，会影响口腔黏膜的正常代谢，从而引发口腔溃疡，有调查显示，约30%的口腔溃疡患者存在维生素B族缺乏的情况。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关，例如锌元素缺乏会影响细胞的正常分裂和修复，导致口腔溃疡不易愈合，约25%的口腔溃疡患者存在微量元素缺乏的情况。