三个月婴儿发烧，多由风寒入侵、细菌感染、病毒感染等引起，可依因处理。具体如下：
一、风寒入侵：平时若未做好保暖，易使身体受风寒侵袭，从而引发体温上升。处理方法包括用湿毛巾擦拭身体，多喝水，还要定期复查。因为风寒入侵后，通过擦拭身体能帮助散热，多喝水可促进新陈代谢，而定期复查能及时了解恢复情况。
二、细菌感染：身体受细菌感染会致体内白细胞升高，进而出现发热。可采取用湿毛巾擦拭手心脚心等位置，同时遵医嘱使用阿莫西林颗粒、对乙酰氨基酚口服溶液等药物进行治疗。擦拭手心脚心能一定程度散热，使用药物可抗菌消炎和缓解发热症状。
三、病毒感染：婴儿受病毒感染会有鼻塞、打喷嚏等情况，同时伴有体温升高现象。可遵医嘱使用磷酸奥司他韦颗粒、布洛芬颗粒等药物治疗，以防病情加重。因为这些药物能抗病毒和退热，帮助婴儿缓解不适。
此外，也可能是自身抵抗力较弱等其他原因。日常生活中，家长一定要重视婴儿的防护。
总之，对于三个月婴儿发烧，要明确原因并采取合适的措施，同时要注重日常对婴儿的照顾和防护。