尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50% - 70%的尿道炎是由革兰阴性杆菌导致的，其中最常见的就是大肠杆菌。
病原体感染途径
尿道邻近器官感染蔓延： 当周边器官发生感染时，病原体可能会蔓延至尿道引发炎症。比如膀胱炎，炎症如果没有得到有效控制，细菌就有可能逆行感染尿道，从而诱发尿道炎。不洁性行为传播： 不洁的性行为是尿道炎的重要诱因之一。像淋球菌、沙眼衣原体等病原体可通过性接触传播，在无保护措施的高危性行为后，就容易感染尿道炎。例如，有多个性伴侣的人群，感染尿道炎的风险比单一性伴侣人群要高很多。
个人卫生习惯因素
不注重局部清洁： 日常不注意外阴部的清洁，会使细菌等病原体容易在尿道周围滋生。比如长时间不更换内裤，或者不清洗外阴，就为病原体感染尿道创造了条件。一般建议每天用清水清洗外阴，保持局部清洁干燥。过度清洁导致菌群失调： 虽然要保持清洁，但过度清洁也不行。过度使用洗液清洗会破坏尿道周围的正常菌群平衡，使得有害菌更容易繁殖，增加尿道炎的发病几率。正常情况下，维持尿道自身的菌群生态平衡很重要，过度清洗会打破这种平衡。
机体免疫力低下原因
疾病影响免疫力： 一些慢性疾病会使机体免疫力下降，从而容易引发尿道炎。比如糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，白细胞的吞噬作用减弱，更容易受到病原体的侵袭，患尿道炎的概率相对较高。长期服用免疫抑制剂： 长期服用免疫抑制剂的人群，如器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排异反应的患者，其自身免疫力处于较低水平，抵御病原体的能力减弱，也就更容易患上尿道炎。