肠道功能紊乱常见的症状有很多，比如消化系统方面，约有50%左右的患者会出现腹痛，疼痛部位不固定，一般在排便前较为明显，排便后可得到一定缓解。
消化系统症状表现
腹痛： 多数患者会有不同程度的腹痛，疼痛程度不一，可为隐痛、胀痛等，部位多在脐周。一般来说，进食后疼痛可能会加重，但排便、排气后会有所减轻。腹胀： 约有60% - 70%的肠道功能紊乱患者会出现腹胀症状，尤其在进食较多产气食物后，腹胀会更加明显，感觉腹部胀满不适，外观可能可见腹部膨隆。腹泻： 部分患者会出现腹泻，大便次数增多，可为稀便，每天排便次数可能在3 - 5次不等，有的患者可能会伴有黏液，但无脓血。便秘： 也有患者表现为便秘，大便干结，排便困难，每周排便次数少于3次，粪便如羊粪状等。
全身症状表现
精神症状： 不少患者会伴有精神症状，约有40% - 50%的患者会出现失眠、焦虑、抑郁、头痛等情况。比如有的患者会因为肠道不适而出现焦虑情绪，进而影响睡眠，导致失眠。疲劳乏力： 约有30% - 40%的患者会感觉疲劳乏力，即使经过休息也难以缓解，影响日常生活和工作状态。
其他表现
食欲改变： 患者的食欲可能会发生改变，有的患者会出现食欲减退，不想进食；而有的患者则可能出现食欲亢进，总是感觉饥饿。排便习惯改变： 除了腹泻或便秘外，还可能出现排便习惯的改变，比如原本排便规律的人，现在变得没有规律，时而腹泻时而便秘交替出现等情况。