大便有出血且肛门疼，应前往结直肠肛门外科或肛肠外科检查，以明确导致大便出血伴肛门疼痛的原因，并依据不同疾病进行相应处理，常见疾病如下：
一、痔疮：
1.痔疮出血伴肛门疼痛时，可使用痔疮膏和痔疮栓来治疗，如马应龙痔疮膏、复方角菜酸酯乳膏、复方角菜酸酯栓等。
2.痔疮出血还可口服地奥司明、迈之灵，以减轻静脉曲张和水肿，降低出血情况。
二、肛裂：
若为陈旧性肛裂，往往需要手术治疗。
三、肛门肌肉问题：
1.肛门肌肉若有痉挛或失弛缓的状况，可能需要在肛门周围进行肉毒素注射、开展肛门解痉治疗。
四、肿瘤：
直肠和肛门肿瘤，如直肠下端的直肠癌或肛管癌等，可能需要手术处理。若肿瘤处于晚期无法手术，则可能需要放疗或化疗等。
五、脓肿：
直肠壁内脓肿、肛门周围脓肿引发的破溃、出血，此时或许也需要进行手术、引流等治疗。
总结概况提示：当出现大便出血伴肛门疼痛时，要及时就医检查并明确原因，针对不同疾病采取合适的治疗措施，包括药物治疗、手术治疗等。