泌尿系感染通常是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的。比如，大约有80%的泌尿系感染是由大肠埃希菌引起的。
致病菌入侵途径
上行感染：这是最常见的途径，细菌由尿道上行进入膀胱，甚至可蔓延至肾脏。比如女性尿道短而宽，且靠近肛门，大肠杆菌更容易从尿道侵入，所以女性泌尿系感染的发生率比男性高很多。血行感染：少见，多发生于免疫力低下或原有严重疾病的患者。细菌从身体其他部位的感染灶，通过血液循环到达泌尿系统引发感染，如皮肤感染、疖痈等病灶的细菌可经血流传播到泌尿系统。
易感因素
尿路梗阻：如尿路结石、前列腺增生等，会导致尿液排出不畅，细菌容易在局部繁殖，引发感染。据统计，尿路梗阻患者发生泌尿系感染的几率比正常人群高10多倍。泌尿系统结构异常：像先天性输尿管畸形、肾盂输尿管连接部狭窄等，会影响尿液的正常流动和排出，为细菌滋生创造条件。机体免疫力低下：糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人，身体抵抗力较弱，容易受到细菌侵袭引发泌尿系感染。比如糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中葡萄糖含量高，有利于细菌生长繁殖。导尿等医源性操作：导尿管的插入会破坏尿道黏膜的屏障，使细菌容易进入泌尿系统，据相关研究，一次导尿后泌尿系感染的发生率约为1%，多次导尿后发生率会显著升高。