5岁宝宝睡觉磨牙的原因主要包括以下几种，相应的处理方式如下：
一、牙龈炎及龋齿：这是5岁宝宝睡觉磨牙较为常见的原因之一。通常会伴有牙龈疼痛以及食欲下降等表现。对此，建议及时带宝宝去医院就诊，可适当进行抗感染等治疗，如此能使症状得到显著改善。比较常用的药物有头孢克洛等。
二、微量元素缺乏：部分5岁宝宝睡觉磨牙可能是由于微量元素缺乏，尤其是钙、铁的缺乏。一般会出现生长发育落后、多汗、腿疼以及贫血、注意力不集中等情况。建议完善钙离子、游离铁以及铁蛋白等相关检查来明确。对于这种情况，建议及时补充钙元素以及铁元素，比如可以让宝宝多喝牛奶、多吃动物性食物以及动物内脏等，这样能够促进症状的改善。
三、肠道寄生虫感染：部分5岁宝宝睡觉磨牙还可能与肠道寄生虫感染有关，特别是蛔虫、饶虫等。一般会有消瘦、食欲下降以及腹痛等症状伴随。建议及时进行驱虫处理，比如使用阿苯达唑等药物。
总之，当发现5岁宝宝睡觉磨牙时，要注意观察宝宝的其他症状，及时查找原因，并采取相应的处理措施，以保障宝宝的健康。