肠胃功能紊乱可以使用一些调节胃肠动力、改善消化的药物来缓解，比如常用的有多潘立酮等。一般来说，通过合理用药能在一定程度上改善症状，但具体效果因个体差异有所不同。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮： 它能促进胃肠蠕动，加快胃排空，缓解腹胀、早饱等症状。适用于因胃肠动力不足导致的肠胃功能紊乱。不过，1岁以下婴儿由于其血脑屏障发育不完善，使用多潘立酮可能会有潜在风险，需谨慎。莫沙必利： 也是促进胃肠动力的药物，可用于改善消化不良、烧心、嗳气等肠胃功能紊乱相关症状。但对于严重肾功能不全的患者，使用时需要密切监测，因为可能会对药物代谢产生影响。
助消化类药物
乳酶生： 是一种传统的助消化药物，它含有活肠链球菌，能在肠道内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制腐败菌的生长繁殖，并防止肠内发酵，减少产气，适用于消化不良、肠胀气等肠胃功能紊乱情况。不过，乳酶生不能与抗菌药物同时服用，否则会影响其疗效。健胃消食片： 由太子参、陈皮、山药、麦芽（炒）、山楂等成分组成，具有健胃消食的作用，可用于脾胃虚弱所致的食积，症见不思饮食、嗳腐酸臭、脘腹胀满等肠胃功能紊乱表现。儿童服用时需要在成人监护下进行，且不能过量服用。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等肠道有益菌，能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善肠胃功能紊乱引起的腹泻、便秘等症状。不过，该药物应冷藏保存，以保持活菌的活性。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 以活菌进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌有促进生长作用，从而调整肠道菌群失调，改善肠胃功能。使用该药物时，应避免与抗菌药物同时服用，若必须服用，需间隔2-3小时。