夜里发烧39度可采取如下方法予以治疗：
一、多喝白开水：发烧时呼吸会加快，进而导致体液流失，多饮白开水有助于补充水分，促进新陈代谢。发烧时人体通常会有发冷之感，此时可饮用一些生姜水，因为生姜具备驱寒的作用。
二、擦拭身体：发烧至39度时可用温水擦拭全身，特别是额头、手心、脚心等部位。也可用70%的酒精进行擦拭，这有利于体内热量的散发。
1.温水擦拭：温水能使皮肤血管扩张，促进热量散发。
2.酒精擦拭：酒精挥发快，能更快地带走热量。
三、泡脚：通过泡脚可促进腿部血液循环，帮助发汗散热，从而达到退热的效果。有条件的话还能选择一些中药材来泡脚，但要注意泡脚的水温不可过烫，以防造成烫伤。
1.促进血液循环：加速血液流动，利于热量散发。
2.发汗散热：帮助身体排出热量，降低体温。
四、补充维生素：尤其要补充维生素C。一般在医院输液时医生也会补充维生素，维生素C是天然的抗生素，具有消炎、抗过敏以及提高免疫力的功效。
五、药物治疗：当人的体温达到38.5℃时，临床上可服用布洛芬颗粒或者对乙酰氨基酚颗粒，同时也可配合使用退热贴以及实施物理降温等措施。
总之，夜里发烧39度时，可综合运用这些方法来缓解症状和降低体温，若发烧持续不退或伴有其他严重症状，应及时就医。