新生儿黄疸是新生儿期常见的现象，约60%足月儿和80%早产儿会出现生理性黄疸。导致新生儿黄疸的原因主要有以下几方面：
胆红素生成过多
红细胞破坏多： 胎儿在宫内处于相对缺氧环境，红细胞数量较多，出生后血氧含量增高，大量红细胞被破坏，从而产生较多胆红素。据统计，新生儿红细胞寿命相对较短，仅为70~90天，比成人短很多，所以更容易被破坏，导致胆红素生成增加。血红素加氧酶含量高： 新生儿体内血红素加氧酶含量比成人高，这种酶能促进血红素转化为胆红素，使得胆红素生成增多。
肝脏胆红素代谢障碍
肝细胞摄取胆红素能力不足： 新生儿肝脏内Y、Z蛋白含量低，这两种蛋白是肝细胞摄取胆红素的重要载体，所以摄取胆红素的能力相对较弱，导致胆红素在体内堆积。肝脏结合胆红素功能差： 新生儿肝脏内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UDPGT）含量低且活性不足，该酶是将未结合胆红素转化为结合胆红素的关键酶，所以结合胆红素的能力有限，使得未结合胆红素不能及时转化为结合胆红素排出体外。
胆汁排泄障碍
胆道排泄不畅： 新生儿胆道排泄功能不完善，可能存在胆道闭锁等情况，导致结合胆红素排泄受阻，从而使胆红素在体内积聚引起黄疸。比如部分新生儿出生后胆道发育异常，胆汁无法正常排出，就会出现黄疸持续不退且进行性加重的情况。肠肝循环增加： 新生儿肠道内正常菌群尚未完全建立，肠道内葡萄糖醛酸苷酶活性较高，可将结合胆红素水解成未结合胆红素，又被肠道重新吸收进入肝肠循环，使得血中未结合胆红素增加，加重黄疸。