长期没吃早餐对身体有诸多不良影响。研究发现，长期不吃早餐的人患胆结石的风险会增加，因为胆汁长时间储存，胆固醇易析出形成结石。
对消化系统的影响
胃肠功能紊乱：长期不吃早餐，胃长时间处于空虚状态，胃酸没有食物中和，会刺激胃黏膜，容易引发胃炎、胃溃疡等疾病。而且胃肠蠕动节律被打乱，影响消化功能，导致消化不良、便秘等问题。一般来说，正常的胃肠消化节律被破坏后，短时间内就可能出现不适，长期下去问题会更严重。胆囊健康受影响：胆汁是帮助消化脂肪的，正常情况下，进食会刺激胆囊收缩排出胆汁。长期不吃早餐，胆汁在胆囊内储存时间过长，胆汁中的胆固醇等成分易沉积，增加胆结石的发病几率。
对血糖代谢的影响
血糖波动大：早餐是一天中补充能量的重要一餐，长期不吃早餐，到了上午血糖水平可能偏低，出现头晕、乏力、注意力不集中等症状。而到了中午或下午，又可能因过度饥饿而进食过多，导致血糖大幅波动，长期如此不利于血糖的稳定，还可能增加患糖尿病的风险。通常经过一夜的消耗，人体血糖在早晨处于较低水平，若不吃早餐，这种低血糖状态持续时间一长就会引发上述问题。
对营养摄入的影响
营养不均衡：早餐应该提供人体所需的多种营养物质，如碳水化合物、蛋白质、维生素、矿物质等。长期不吃早餐，会导致身体无法获取全面的营养，长此以往可能出现营养不良的情况，影响身体的正常生长发育（对于儿童青少年）或身体健康状态。例如，长期缺乏维生素会使皮肤状态变差、免疫力下降等，缺乏蛋白质会导致体力不支、肌肉减弱等。
对大脑功能的影响
影响认知能力：大脑的正常运转需要充足的能量供应，而早餐提供的营养是大脑获取能量的重要来源。长期不吃早餐，大脑能量供应不足，会影响记忆力、注意力、反应速度等认知功能，使人在学习或工作时效率降低。有研究表明，长期不吃早餐的学生，在课堂上的注意力集中时间会缩短，学习成绩可能受到一定影响。