大便时肛门痛，可能是以下原因引起：
1.肛裂：
病因：肛裂是肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，主要由便秘或腹泻引起。
原理：肛管表面的黏膜和皮肤由自主神经控制，痛觉敏感，而肛裂裂口的创面是受躯体神经支配，痛觉迟钝，所以，患者在排便时，会先因粪便刺激肛裂的创面而感觉到肛门疼痛，然后因肛管皮肤裂伤，便后会有持续的刀割样疼痛。
2.外痔：
病因：外痔是齿状线以下的痔外静脉丛扩大曲张或反复发炎而成，其表面被皮肤覆盖，位于肛管内。
原理：肛缘皮下静脉丛形成的小血栓，在肛门部受到刺激时会疼痛。
3.肛管及周围炎症：
病因：常见的有肛窦炎、肛乳头炎、肛周脓肿、肛瘘等，这些疾病也会引起肛门疼痛。
原理：炎症急性期，患者会感觉到肛门部灼痛、湿痒，有时还会出现剧痛。
4.肛管或直肠肿瘤：
病因：肛管、直肠肿瘤溃烂感染，或肛管、直肠炎等也会导致肛门疼痛。
原理：肿瘤会导致肛管或直肠黏膜受到刺激，引起疼痛。
如果出现大便时肛门痛的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。