宝宝反复高烧39°C可能由多种原因引起，以下是一些常见的因素：
1.感染性疾病：如病毒、细菌、支原体等感染，是导致宝宝高烧的最常见原因。呼吸道感染、肺炎、肠胃炎等都可能引起发热。
2.免疫系统反应：宝宝的免疫系统尚未完全发育成熟，有时对感染或其他刺激会产生过度反应，导致高烧。
3.幼儿急疹：这种疾病多见于6个月至2岁的宝宝，通常在高烧3-5天后出疹，烧退疹出。
4.其他原因：疫苗接种后、川崎病、幼年特发性关节炎等也可能引起宝宝反复高烧。
需要注意的是，高烧可能会对宝宝的身体造成一定的影响，如热性惊厥、脱水等。因此，如果宝宝出现反复高烧，应及时就医，进行相关检查，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，家长可以采取物理降温的方法，如给宝宝多喝水、温水擦浴、使用退热贴等，帮助宝宝缓解不适。在就医过程中，家长应详细告知医生宝宝的症状、发病时间、用药情况等，以便医生做出准确的诊断和治疗。