宝宝反复高烧39度，可能是由以下原因引起的：
1.感染性疾病：这是最常见的原因，如病毒、细菌、支原体等感染。宝宝可能会出现感冒、肺炎、扁桃体炎等症状。
病毒感染：如流感病毒、呼吸道合胞病毒等，常伴有流涕、咳嗽、打喷嚏等症状。
细菌感染：如肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等，除了发热外，还可能有咳嗽、咳痰、呼吸急促等症状。
支原体感染：常表现为发热、咳嗽、咽痛等症状。
2.非感染性疾病：除了感染性疾病外，还有一些其他原因也可能导致宝宝反复高烧39度，如免疫性疾病、恶性肿瘤、药物热等。
免疫性疾病：如川崎病、幼年特发性关节炎等，除了发热外，还可能有皮疹、关节痛、淋巴结肿大等症状。
恶性肿瘤：如白血病、淋巴瘤等，除了发热外，还可能有贫血、出血、淋巴结肿大等症状。
药物热：某些药物可能会引起发热，尤其是在使用青霉素、头孢菌素等抗生素后。
3.其他原因：还有一些其他原因也可能导致宝宝反复高烧39度，如环境温度过高、穿着过多、剧烈运动等。
如果宝宝出现反复高烧39度的情况，建议及时就医，进行详细的检查，如血常规、C反应蛋白、支原体抗体、胸片等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意给宝宝多喝水，保持室内空气流通，避免过度包裹。