手掌肉里面长硬疙瘩并伴有疼痛，可能是多种原因引起的，以下是一些可能的情况和建议：
1.寻常疣：由人乳头瘤病毒感染引起，可通过直接或间接接触传播。寻常疣通常表现为质地较硬、表面粗糙的丘疹，可单发或多发，可无明显症状，也可伴有疼痛、瘙痒或出血。如果确诊为寻常疣，可采用冷冻、激光、电灼等方法进行治疗。
2.鸡眼：由于长期受压或摩擦，导致皮肤角质层增厚形成的圆锥形角质栓。鸡眼通常好发于脚掌前中部、小趾外侧或拇趾内侧缘，行走或站立时可引起疼痛。治疗鸡眼可采用鸡眼膏、水杨酸软膏等药物，也可通过手术、激光等方法去除。
3.胼胝：长期机械刺激引起的局限性扁平角质斑块，与职业有关，多无症状，严重时可有压痛。一般无需治疗，避免局部摩擦和受压即可。若因美观或影响功能，可采用热水浸泡、削除等方法治疗。
4.掌跖脓疱病：病因尚不明确，可能与感染、金属过敏、自身免疫等因素有关。掌跖脓疱病好发于手掌和足底，表现为红斑基础上的脓疱，可伴有瘙痒或疼痛。治疗掌跖脓疱病可采用外用药物（如糖皮质激素、维生素D3衍生物等）、口服药物（如免疫抑制剂、抗生素等）或光疗等方法。
5.其他：手掌肉里面长硬疙瘩并伴有疼痛，还可能是其他疾病的表现，如皮肤肿瘤、类风湿关节炎、腱鞘炎等。如果硬疙瘩持续不消失或逐渐增大，或伴有其他症状（如发热、乏力、关节疼痛等），应及时就医，进行相关检查（如血常规、X线、病理检查等），以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况可能因个体差异而有所不同。如果手掌肉里面长硬疙瘩并伴有疼痛，建议及时就医，由专业医生进行诊断和治疗。在就医前，应避免自行挤压、搔抓或使用刺激性药物，以免加重病情。同时，应注意保持手部清洁，避免长时间接触水、肥皂、洗衣粉等刺激性物质，避免手部过度劳累和受伤。