大便时肛门疼可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，大便时可因摩擦而引起疼痛。
3.内痔或混合痔：内痔或混合痔发展到一定程度时，可出现内痔脱出或痔核肿胀、发炎、嵌顿而引起疼痛。
4.肛管及周围炎症：肛窦炎、肛乳头炎、肛周脓肿、肛瘘等均可引起肛门疼痛。
5.肛门损伤：如肛裂、侧切后伤口未愈合、肛管或直肠内异物损伤、肛管或直肠恶性肿瘤等，均可引起肛门疼痛。
6.其他：如直肠炎、肛乳头肥大、肛管直肠脱垂、耻骨直肠肌综合征等，也可引起肛门疼痛。
如果经常出现大便时肛门疼的情况，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。