先天性胆总管囊肿的治疗方法主要有以下几种：
1.囊肿切除：这是治疗先天性胆总管囊肿最常用的方法。通过手术将囊肿完整切除，并行胆肠吻合，以恢复胆道的正常结构和功能。
对于囊肿较小、无明显症状的患儿，可在出生后6~12个月进行手术。
对于囊肿较大、有明显症状或出现并发症的患儿，应尽早手术。
2.胆肠吻合术：如果囊肿与十二指肠之间有共同通道，可采用胆肠吻合术，将胆汁引流入肠道。
3.肝门空肠吻合术：对于胆总管囊肿并发肝内胆管扩张的患儿，可采用肝门空肠吻合术，使胆汁直接流入空肠。
4.其他治疗：如囊肿穿刺引流、放疗、化疗等，通常作为辅助治疗方法。
需要注意的是，先天性胆总管囊肿的治疗应根据患儿的具体情况制定个性化的治疗方案。在治疗过程中，家长应密切配合医生，注意患儿的营养支持和术后护理，定期复查，以确保患儿的康复。