宝宝发烧39度吃药不退，可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因和建议：
1.病因未除：发烧是身体对抗感染的一种反应，如果病因没有得到去除，比如细菌、病毒或其他感染源没有被完全清除，发烧可能会持续。此外，一些其他疾病如肺炎、扁桃体炎等也可能导致发烧不退。如果宝宝除了发烧还有其他症状，如咳嗽、流鼻涕、喉咙痛等，建议及时就医，进行相关检查，以确定病因，并采取相应的治疗措施。
2.药物使用不当：有些退烧药可能需要按照体重或年龄来计算正确的剂量，如果使用不当可能导致药效不佳。此外，如果退烧药与其他药物同时使用，可能会发生相互作用，影响药效。如果宝宝吃药后发烧不退，建议咨询医生或药剂师，确认药物的使用方法和剂量是否正确。
3.水分摄入不足：发烧会导致宝宝体内水分流失，如果没有及时补充水分，可能会影响退烧药的效果。建议给宝宝多喝水，以保持身体水分充足。
4.免疫系统尚未成熟：宝宝的免疫系统尚未完全发育成熟，对于感染的反应可能不如成人强烈。在这种情况下，发烧可能会持续一段时间。但是，如果宝宝的精神状态良好，食欲正常，通常不需要过于担心。
5.其他因素：有些宝宝可能对某些药物过敏，或者存在其他潜在的健康问题，如免疫系统缺陷等，也可能导致发烧不退。如果宝宝有其他特殊情况或家族病史，建议及时告知医生。
针对宝宝发烧39度吃药不退的情况，以下是一些建议：
1.观察宝宝的精神状态和食欲：如果宝宝的精神状态良好，食欲正常，可以继续观察，并按照医生的建议使用退烧药。如果宝宝出现精神萎靡、嗜睡、食欲不振等异常情况，应及时就医。
2.物理降温：除了药物治疗外，还可以采用物理降温的方法，如温水擦浴、使用退热贴等。但是，对于小于3个月的宝宝，不建议使用物理降温方法。
3.保持室内通风：保持室内空气流通，温度适宜，可以让宝宝感到舒适。
4.避免捂汗：不要给宝宝穿过多的衣物或盖太厚的被子，以免影响散热。
5.就医复诊：如果宝宝发烧持续不退，或者出现其他异常症状，应及时就医复诊，以便医生调整治疗方案。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果对宝宝的病情有任何疑虑或担忧，建议及时咨询医生的意见。同时，在宝宝发烧期间，要密切观察宝宝的病情变化，确保宝宝的安全和健康。