宝宝发烧39度吃药不退，可能是由感染、免疫系统问题、药物副作用等原因引起的。可以通过物理降温、就医检查、调整治疗方案等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.感染：这是导致宝宝发烧最常见的原因，如病毒、细菌、支原体等感染。如果感染没有得到有效控制，发烧可能会持续。
2.免疫系统问题：某些宝宝的免疫系统可能存在问题，导致对感染的反应异常，从而引起持续发烧。
3.药物副作用：某些退烧药可能会导致宝宝体温不降反升，或者出现其他不良反应。
4.其他原因：如药物使用不当、宝宝自身基础疾病等也可能导致发烧持续不退。
在治疗期间，家长需要注意以下几点：
1.给宝宝多喝水，以补充因发烧而流失的水分。
2.保持宝宝的皮肤清洁，及时更换汗湿的衣物。
3.密切观察宝宝的精神状态、呼吸等情况，如有异常应及时就医。
4.可适当给宝宝进行物理降温，如温水擦浴、使用退热贴等。
5.避免给宝宝穿过多的衣物或包裹过严，以免影响散热。
家长可适当给宝宝食用富含维生素C、水分的食物，如水果、蔬菜等，避免食用辛辣、油腻的食物。