济生肾气丸与金匮肾气丸的主要区别在于药物组成和功效的侧重点不同。
济生肾气丸是在金匮肾气丸的基础上加了车前子和牛膝。因此，济生肾气丸具有金匮肾气丸温肾化气、利水消肿的功效，同时还可增加利尿的作用。
济生肾气丸主要用于治疗肾阳虚衰、水湿内停所致的肾虚水肿、腰膝酸重、小便不利、痰饮咳喘。而金匮肾气丸则更偏重于治疗肾阳不足、腰膝冷痛、肢体浮肿、小便不利或反多、消渴等。
需要注意的是，济生肾气丸和金匮肾气丸均为处方药，应在医生的指导下使用，严格按照药品说明书或医嘱用药。同时，在服用这两种药物期间，应避免食用辛辣、油腻、生冷等食物，以免影响药效。如果正在使用其他药物，也应提前告知医生，以免发生药物相互作用。