早上起来腰两侧酸痛，可能与以下原因有关：
1.床垫太软或太硬：不合适的床垫会使腰部得不到有效支撑，导致肌肉紧张和酸痛。
2.腰部肌肉劳损：长时间保持一个姿势或过度使用腰部肌肉，容易引起肌肉劳损。
3.泌尿系统感染：如肾炎、肾盂肾炎等，可导致腰部酸痛。
4.腰椎间盘突出：椎间盘突出可压迫神经根，引起腰部疼痛。
5.妇科疾病：如盆腔炎、宫颈炎等，也可能导致腰部酸痛。
针对不同原因引起的腰两侧酸痛，治疗方法也有所不同：
1.调整床垫：选择适合自己的床垫，保证腰部得到充分支撑。
2.腰部锻炼：加强腰部肌肉的锻炼，如仰卧起坐、瑜伽等。
3.治疗感染：如有泌尿系统感染，需及时就医，使用抗生素进行治疗。
4.治疗腰椎间盘突出：根据病情轻重，可选择保守治疗或手术治疗。
5.治疗妇科疾病：针对妇科疾病进行相应的治疗，如抗炎、手术等。
如果腰两侧酸痛持续时间较长或症状加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取针对性的治疗措施。此外，日常生活中应注意保持良好的姿势，避免长时间弯腰或久坐，同时注意腰部保暖，避免受寒。