吃东西时耳根疼，可能与以下原因有关：
1.颞下颌关节紊乱：咀嚼时，耳前区的颞下颌关节会运动。如果长期偏侧咀嚼、夜间磨牙，或精神压力大、寒冷刺激等，可能导致颞下颌关节功能紊乱，从而出现吃东西时耳根疼的症状。此外，还可能伴有张口受限、关节弹响等症状。
2.耳部疾病：中耳炎、外耳道炎等耳部疾病，也可能导致吃东西时耳根疼。此外，耳部的带状疱疹，病毒可侵犯面神经及听神经，也会出现耳根疼痛的症状。
3.口腔疾病：牙龈炎、智齿冠周炎等口腔疾病，炎症可能扩散至耳部，从而引起耳根疼痛。
4.其他：颈椎病、腮腺炎等也可能导致吃东西时耳根疼。
如果出现吃东西时耳根疼的症状，建议及时就医，明确原因。此外，日常生活中应注意以下几点：
1.避免过度张口，如打哈欠时应用手托住下巴。
2.避免食用坚硬的食物，以免加重关节负担。
3.注意耳部卫生，保持耳部清洁干燥。
4.及时治疗口腔疾病。
5.保持良好的生活习惯，避免熬夜、过度劳累。
6.注意保暖，避免耳部受到寒冷刺激。
以上内容仅供参考，具体治疗方法请以医生的建议为准。