川牛膝和怀牛膝均为苋科植物，且都具有逐瘀通经、通利关节、利尿通淋等功效，但其来源、性状、功效等方面均有不同。具体分析如下：
1.来源：川牛膝为苋科植物川牛膝的干燥根；怀牛膝为苋科植物牛膝的干燥根。
2.性状：川牛膝根呈近圆柱形，微扭曲，向下略细或有少数分枝，长30-60cm，直径0.5-3cm。表面黄棕色或灰褐色，具纵皱纹、支根痕和多数横向突起的皮孔。质韧，不易折断，断面浅黄色或棕黄色，维管束点状，排列成数轮同心环。气微，味甜。怀牛膝根呈细长圆柱形，有时稍弯曲，上端较粗，长30-100cm，直径0.4-1cm。表面灰黄色或淡棕色，有细纵皱纹和稀疏的侧根痕。质硬而脆，易折断，断面平坦，黄棕色，微呈角质样而油润。气微，味微甜而涩。
3.功效：川牛膝逐瘀通经，通利关节，利尿通淋。用于经闭症瘕，胞衣不下，关节痹痛，足痿筋挛，尿血血淋，跌扑损伤。怀牛膝逐瘀通经，补肝肾，强筋骨，利尿通淋，引血下行。用于经闭，痛经，腰膝酸痛，筋骨无力，淋证，水肿，头痛，眩晕，牙痛，口疮，吐血，衄血。
综上所述，川牛膝和怀牛膝的区别主要在于来源、性状和功效等方面。在使用时，应根据具体病情和体质，选择合适的牛膝进行治疗。