跑步时膝盖疼痛的原因主要有以下几点：
1.准备活动不充分：如果在跑步前没有进行充分的热身，身体各部位的关节和肌肉没有活动开，容易导致膝盖受伤。
2.跑步姿势不正确：正确的跑步姿势应该是身体微微前倾，头部保持正直，手臂自然摆动，步伐适中，不要过大或过小。如果跑步姿势不正确，会增加膝盖的压力，导致膝盖疼痛。
3.跑鞋不合适：跑鞋是跑步时保护膝盖的重要装备，如果跑鞋不合适，会影响跑步的稳定性和减震效果，增加膝盖的压力。
4.跑步强度过大：如果跑步强度过大，超出了身体的承受能力，容易导致膝盖受伤。
5.膝关节本身的问题：如果本身膝关节存在疾病，如滑膜炎、半月板损伤等，跑步时会加重病情，导致膝盖疼痛。
总之，跑步时膝盖疼痛可能是多种原因引起的，如果疼痛持续时间较长或症状加重，建议及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。同时，在跑步前要进行充分的热身，选择合适的跑鞋，掌握正确的跑步姿势，控制跑步强度，避免过度疲劳。如果已经出现膝盖疼痛的症状，可以采取适当的休息、冷敷、按摩等措施，如果症状严重，建议及时就医。