肚脐上方三指处疼痛可能与以下原因有关：
1.胃部疾病：常见的如胃炎、胃溃疡等，疼痛通常与进食有关，常伴有烧心、反酸、恶心等症状。
2.十二指肠疾病：十二指肠溃疡是常见的疾病，疼痛多在空腹或夜间发作，有时会向背部放射。
3.胰腺疾病：胰腺炎、胰腺癌等疾病也可能导致该部位疼痛，常伴有消化不良、黄疸等症状。
4.心脏疾病：少数情况下，心脏疾病如心肌梗死、心绞痛等也可能引起上腹部疼痛，疼痛可能向左肩部放射。
5.其他：胸膜炎、肺炎、肋间神经炎等胸部疾病，以及腹部肌肉拉伤、腹壁疝等也可能导致该部位疼痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、呕吐、黑便等，应及时就医，进行相关检查，如胃镜、腹部超声、心电图等，以明确病因，并进行针对性治疗。在就医前，应注意休息，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，避免饮酒和吸烟。