肚脐正上方三指位置疼，可能与以下原因有关。
1.胃部疾病：常见的如胃炎、胃溃疡等，疼痛通常与进食有关，常伴有烧心、反酸、腹胀等症状。
2.十二指肠疾病：比如十二指肠溃疡，疼痛多在空腹或夜间发作，进食后可缓解。
3.胰腺疾病：胰腺炎、胰腺癌等可导致该部位疼痛，还可能伴有恶心、呕吐、发热等症状。
4.心脏疾病：少数情况下，心绞痛、心肌梗死等心脏疾病也可能表现为上腹部疼痛，可向左肩、左臂放射。
5.其他：如胸膜炎、肺炎、肋间神经炎等，也可能引起该部位疼痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，进行相关检查，如胃镜、腹部超声、心电图等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，在就医前应注意休息，避免剧烈运动和进食刺激性食物。对于孕妇、老年人、有慢性疾病的人群，出现该部位疼痛应更加重视，及时就医。